Целью Отдела в его уставе было обозначено «изучение Сибири преимущественно в экономическом, культурном и правовом отношении, а также содействие подготовлению и проведению в жизнь насущных для Сибири преобразований». Особое внимание в начале своей деятельности Красноярский отдел ОИС уделял истории Енисейской губернии и г. Красноярска.