Комплекс основан на базе мерзлотной лаборатории и расположен в толще вечномерзлого грунта, глубина которого достигает 14 м. В настоящее время музей включает в себя отдел природы, где демонстрируются древние виды льдов, растительности и изображения животных ледникового периода, отдел «Стройка № 503», рассказывающий об истории строительства железной дороги Салехард — Игарка, отдел истории и отдел фондов.
